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猕猴桃抗溃疡病新种质基因发掘和标记

admin2018-08-30

       从NCBI数据库中(www.ncbi.nlm.nih.gov/bdEST/index.heml)下载猕猴桃表达序列标签(expressed sequence tag,EST),利用MISA软件对其进行SSR位点查找,将符合条件的序列选出,利用 Primer3.0 Plus 软件设计引物,由北京奥科生物公司合成。


(2)基因组DNA提取


      猕猴桃基因组DNA提取采用CTAB法。春季取1年生枝条上的健康嫩叶,采用简易CTAB法提取基因组DNA,获得的DNA经琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计检测合格后,将样品浓度调至50ng/μL保存备用。


(3)SSR-PCR分析


     SSR-PCR反应体系、SSR-PCR扩增程序参照相关试剂盒说明书进行,遗传多样性分析选用8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,电泳约5h,银染显色后干燥后统计带型并拍照。


(4)基因克隆


     抗性材料接种溃疡病菌后0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7天采回幼嫩叶片,采用提取RNA。采用Promega公司的反转录试剂盒合成cDNA。根据本项目研究获取的猕猴桃抗溃疡病分子标记设计引物,由北京奥科生物公司合成。采用PCR法克隆相关基因,按照相关试剂盒说明书进行,阳性克隆测序由北京奥科生物公司完成。


(6)抗性分子标记


    通过大量的引物扩增,引物UDK97-428在YZ310抗性品种中获得了一条116bp条带,而在感性品种无此条带。进一步用不同品种对UDK97-428-116标记进行验证,发现毛花猕猴桃、SX45872雄株、QM91136、金艳、华优、玉研132、玉研154、秦美、海沃德、翠香、金霞有UDK97-428-116条带,西选二号、红阳、玉研426、玉研101、金桃、金阳无此条带。


(7)基因克隆


    根据UDK97-428-116对应的猕猴桃EST序列设计引物,克隆获得3个抗猕猴桃溃疡病相关基因,已在GenBank登录,登录号为JQ814370,JQ814373,JQ814378,目前正在进行基因功能的研究。


    研究结论:通过采用室内离体接种、盆栽幼树活体接种和抗性基因分子标记三种鉴定方法,验证新种质材料的抗溃疡病特性,表明YZ310 为抗溃疡病砧木材料,玉研132既抗溃疡病、果实又大、品质又好,被确定为美味猕猴桃新种质。


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